查士丁尼皇帝生在（公元482年5月5日或公元483年5月11日）撒尔底迦（现代城市索菲亚）的遗址附近，一个不知名的蛮族家庭，居住在人烟稀少的荒野，这个地方先后称之为达尔达尼亚、达契亚和保加利亚。他后来能够登基，完全靠叔父查士丁的开创精神，先期完成了准备工作。
查士丁和同村的两个农民抛弃务农和畜牧这些熟悉的工作，一起去从军。三个年轻人的背包只装少量干粮，沿着通往君士坦丁堡的大道步行前进，凭他们的体格和身材，很快加入皇帝利奥一世的卫队。经过两个朝代的统治，幸运的农夫拥有了极大的财富和荣誉，数度从威胁到性命的危险中安然脱身，后来被归之于他有帝王的气运，能获得天使的保护。他参加伊索里亚战争和波斯战争，经历长期的服务，建立卓越的功勋，使得人们不会忘记查士丁的名字，保证他在50年的时间里，能够在军队中逐步高升，阶级从护民官、伯爵、将领、元老院议员的荣衔，一直升到卫队的指挥官。在阿纳斯塔修斯皇帝离开人世这个紧要关头，整个卫队始终把他视为首领，听从他的命令。皇帝扶植的亲属虽然有权而且富有，但都被排除在皇座之外，掌理皇宫的宦官阿曼提乌斯暗中决定，要让最逢迎谄媚的人戴上皇冠接位。他为了取得卫队的同意，特地准备了一大笔赏金交给他们的指挥官。但查士丁拿这笔钱为自己打算，违背诺言，运用极为有利的情势：士兵知道他作战英勇而且待人温和，教士和人民相信他是正统基督徒，省民无法分辨，只能以首都唯命是从。在没有对手竞争的状况下，他获得一致的同意，这个达契亚的农民被授予紫袍，登基称帝。
查士丁一世与出身同一家族、名字完全相同的皇帝，在各方面都大相径庭。他到68岁的高龄才登上拜占庭的宝座，要是政事都让他来指导和决定，在这9年的统治期间（公元518年7月10日—527年4月1日或8月1日），任何时刻都可能会让他的臣民后悔怎么会做出这样的选择。他的无知能与狄奥多里克相媲美，在一个学识并不匮乏的时代，同时有两位君王竟然大字不识，这种状况倒不常见。但是查士丁的才华远逊于哥特国王，当兵服役的经验无法用来管理一个帝国，虽然个性英勇，但却对自己的弱点心知肚明，难免使他产生猜疑、缺乏信心、忧虑政事。好在国家的日常事务有忠诚的财务大臣普罗科卢斯分劳分忧，而且年迈的皇帝收养了极具才干和抱负的侄儿查士丁尼。这位积极进取的青年是被叔父从达契亚偏僻的农村带出来的，在君士坦丁堡接受教育，成为私人产业的继承人，最后还获得了整个东部帝国。
宦官阿曼提乌斯用来收买军心的钱财被挪用，就有必要将他灭口，只要随便安上阴谋不轨的罪名，不论是真是假都很容易完成任务。为了使他死罪难逃，法官被告知说他在暗中信奉摩尼教的异端邪说，阿曼提乌斯因而被斩首。他的三个同谋都是皇宫的总管，遭到处死或放逐的惩罚。那个妄想紫袍加身的不幸接班人被扔进阴暗的地牢，头颅被石头砸烂，尸身不予掩埋就被抛进大海。清除维塔利安是一件困难而又危险的工作，这位哥特酋长在内战中为了维护正教信仰，大胆起兵反抗阿纳斯塔修斯，在民间获得很高的声望。最后双方签订了一份有利的条约，让他仍旧率领一支战无不胜的蛮族部队，驻扎在君士坦丁堡附近地区。维塔利安受到引诱，在立下并不可靠的保证以后，放弃原本占有优势的位置，相信自己能安然回到城内。君士坦丁堡的居民，特别是蓝党的成员，想起他那表现宗教虔诚的敌对行为，受到挑拨以后产生愤怒的情绪。皇帝和他的侄子对他的到来表示出热情的欢迎，把维塔利安视为教会和国家忠诚而英勇的斗士，授予这位宠臣执政官和将领的头衔。但是在他接受荣誉职位的7个月后，维塔利安在皇家的宴会中被刺，身上带着17处伤口，查士丁尼被指控是杀害同教弟兄的凶手。不久前查士丁尼还参加基督教的神秘仪式，要用誓言保证双方的忠诚，现在就把维塔利安的一切当作战利品全部接收。等到他的敌手丧命以后，查士丁尼虽然没有在军队服务的经历，仍被擢升为东部军队的主将，负责率领官兵进入战场，迎击国家的敌人。
查士丁尼在追逐声名时，对于年迈而体衰的叔父，可能会失去现在所保有的控制力，因而他并不想借战胜西徐亚人或波斯人来赢得同胞的赞誉。生性谨慎的战士在君士坦丁堡的教堂、赛车场和元老院，想尽办法求取他们的好感。正统教会完全依靠查士丁的侄儿所给予的帮助，他处于聂斯托利派和优迪克派异端的包围之中，行进在坚定不屈和无法妥协的正教那狭窄的道路之上。查士丁尼在开始统治的初期，鼓动民众起而反对逝世的皇帝，使大家的宗教热情得到满足。经过34年的分裂以后，他安抚罗马教皇傲慢和愤怒的情绪，在拉丁人中间散布讨大家欢心的消息，说他对使徒传授的主教职权抱着万分虔诚的尊敬。东部的主教宝座全是正统教派的基督徒，所以才会照顾查士丁尼的利益，他的慷慨获得教士和僧侣的支持，人民受到教诲要为未来的君王祈祷，只有他才是宗教真正的希望和支柱。查士丁尼用庞大无比的排场，展现出公众活动的华丽，在民众的眼中看来，这要比尼斯和卡尔西顿的信条更为神圣和重要。他担任执政官这个职务的花费，估计要值28.8万个金币，在竞技场中同时展出20头狮子和30只花豹，一群马匹佩戴值钱的鞍具和辔头，被当作额外的礼物赠给赛车场获胜的驭车手。
正当查士丁迁就君士坦丁堡的民众和接受外国君王来信的时候，他的侄儿却在极力培养与元老院的友谊，元老院这个可敬的机构使它的成员有资格掌握舆论，左右帝国宝座的继位人选。此前，衰老的阿纳斯塔修斯希望让强势的政府退化到形式或实质上的贵族政体，因而造成这种结果。进入元老院成为议员的军官，加上有私人卫队追随左右，运用这帮身经百战的老兵，凭着他们的武力和声势，可以在动乱的时刻奉上东部帝国的冠冕。查士丁尼浪费国家的财富用来收买议员的支持，皇帝得到通知，元老院经过表决，一致同意请他接受查士丁尼成为他的共治者。这种要求的意味太过于明显，让查士丁知道自己的统治已接近尾声，当然不会对此感到满意。年迈的君主心存猜忌，在无能为力的状况下，还想继续掌握权势。双手抓住紫袍的查士丁对他们提出劝告，既然选举如此有利可图，何不找较为年长的候选人。尽管有这番谴责之词，元老院还是给查士丁尼加上了“尊贵者”这个皇室称号。他的叔父不知是出于爱护还是畏惧，批准了元老院的敕令，没过多久，查士丁的腿部受伤，久治未愈，身心都感到委顿，找一位帮手在旁协助已经是刻不容缓的事。他召集元老院的议员和基督教的教长，当着大家的面举行庄严的仪式，把皇冠放在侄子的头上。查士丁尼在大家簇拥之下从皇宫前往赛车场，接受民众热烈的致敬和大声的欢呼。查士丁的生命又延续了4个月，但是在举行加冕典礼的一刹那，对帝国而言他已寿终正寝。查士丁尼在45岁的盛年，成为东部的合法统治者。