刘瑾搞走了刘健和谢迁后，开始大力打击他们留在朝廷里的势力。
公元1509年二月，余姚的周礼、徐子元、许龙，上虞的徐文彪都是谢迁的同乡，而草拟诏书的是刘健。
刘瑾想把他们一网打尽，同时，借此清算谢、刘二人的罪状。
刘瑾当下假传圣旨，责问朝廷里，余姚官员为何这么多？此必定是徇私情而援引！当下将周礼等人关进诏狱，供词牵连到刘健、谢迁。
刘瑾打算就此逮捕刘健和谢迁，同时没收其家产。
李东阳忙从中极力化解。
焦芳在旁边厉声说：“纵使从轻宽恕，也应当取消原有身份！”
刘瑾赞成焦芳的意见。
不久，圣旨下来，同焦芳说的一样，周礼等余姚官员，都被罚戍边。
尚书刘宇又弹劾刘、谢所辖两部门向上汇报失实，这些官员被判罪罚米，有的削去门籍。
另外，刘瑾借皇帝诏令，从今后余姚人不得当选京官，并写成条文。
这年十二月，言官根据刘瑾的意图，请求收回刘健、谢迁以及尚书马文升、刘大夏、韩文、许进等的诰命，下诏一并追还所赐的玉带衣物，同时被收回诰命的人有六百七十五人。
这样一来，刘瑾势力日渐坐大。
他大力打击抑制朝官，而新入阁的焦芳，不断助长了刘瑾的残暴，老臣、忠直人士几乎被放逐干净。
李东阳愁闷不安，但他小心谨慎地躲避祸患，与刘瑾大好关系。
焦芳嫉妒李东阳位居自己之上，一天到晚在刘瑾面前说李东阳的坏话。
此前，东阳奉命编纂《通鉴纂要》，完成之后，刘瑾命人挑出笔画小毛病，免除誊录官好几名，企图借此祸及李东阳。
李东阳见刘瑾要对自己动手，当下大急，忙放下身段去请焦芳与张彩进行调解，才了结此事。
刘瑾凶恶残暴一天比一天厉害，对大臣无不进行诋毁，态度怠慢，但对李东阳表面上还算尊敬。
李东阳成了救火队员一样，凡是刘瑾扰乱政事所搞的乱子，李东阳左右调适，这才使得政事多有补救。
副使姚祥、郎中张玮因为违反礼制乘轿，随从非法索取驿站马匹，给事中安奎等人由于核实边饷不对刘瑾的意愿，都被戴上沉重的刑具差一点死了。
李东阳全力营救，这才使得他们被释放，削职为民。
正德三年，公元1508年六月二十六日，退朝后，有人将匿名奏章放置在御道上，信中一一列举刘瑾罪行，朱厚照下诏书要文武百官全部跪在奉天门外。
不久，拘捕三百多名官员关进皇家监狱。
第二天，李东阳尽力解救，恰逢刘瑾也查访到匿名奏章是太监所投放的，众官员才获得释放。
过了几天，李东阳上奏章请求宽免抚恤等几件事，奏章下达到有关部门。
不久户部又上奏章，说粮草亏损，自有专门负责的官员，巡抚官掌管大政，应该从轻减罪。
刘瑾大怒，矫造几百字的圣旨责问，朝廷内外都为之震惊叹息。
刘瑾担心盗贼越来越厉害，想派兵看守盗贼家属并邻里以及为他窝藏财物的人家。
有人自称抓获盗贼七十人，所管部门要用新例处理。
李东阳说，如果这样，那么百年的案子都可以追究，这才免除了。
刘健、谢迁、刘大夏、杨一清以及平江伯陈熊一类人几乎遭到危险，都依赖李东阳而得到化解。
李东阳之所以能够救一些刘瑾要他死的人，全是因为李东阳委曲求全，对刘瑾采取迎合的态度。
这就使得许多气节之士责怪他了！
侍郎罗王已写信给李东阳，劝他早日退职，以至于到请求削除自己的门生身分。
李东阳看到信，低头长叹罢了。
他在没有搞倒刘瑾之前，没有肃清朝政之前，他必须忍辱负重！
李东阳知道，想搞倒刘瑾，必须要有自己人，当下援引杨廷和共同处理政事，至于外面领兵的，他重用了杨一清。
杨一清，正是可以搞倒刘瑾的人！
杨一清自小就是神童，十四岁便参加乡试，并且被推荐为翰林秀才。
朱见深这个昏庸的皇帝，都觉得杨一清了不起，命内阁选派老师教他。
成化八年，公元1472年，杨一清考中进士，授中书舍人。
后来，杨一清升任山西按察使司佥事，改陕西副使督学，在陕西任职八年，平时空闲时考察边疆战事。
之后入朝，任太常寺少卿，进南京太常寺卿。
弘治十五年，公元1502年，因刘大夏举荐，杨一清升任都察院左副都御史，担任陕西巡抚，负责督理陕西马政，期间平定边疆进犯、弹劾贪庸总兵武安侯郑宏，并裁减镇守中官费用，使得军纪严明。
朱厚照即位后，数万蒙古军入侵固原，总兵官曹雄拒绝派兵援助。
杨一清率轻骑自平凉昼夜行军，抵御入侵并发动奇袭，击退蒙古军的进犯。
此后，杨一清以延绥、宁夏、甘肃三地有警不相援，请求朝廷任命大臣兼任，管理。
刘大夏于是请求朝廷任命杨一清总制三镇军务，晋升为右都御史。
杨一清在任期间因修建边疆防御，朱厚照很是赞赏并发帑金数十万使其完成防御工事。
太监刘瑾因杨一清不依附自己，而弹劾杨一清，他被迫借病辞职。
之后，刘瑾诬陷杨一清冒领浪费边疆费用，杨一清被逮捕入诏狱。
此时，幸亏李东阳、王鏊极力救护方才救出。
不久，安化王朱寘鐇谋反，李东阳举荐杨一清去平叛。
朱厚照诏令起用杨一清，总制军务，与总兵官神英平叛，并命中官张永担任督军。
他们大军未抵达，杨一清以前的部将仇钺已经平叛并逮捕了朱寘鐇。
杨一清驰马抵达镇县，并宣布皇帝的恩德。
张永随后赶到，俩人相谈甚欢。
杨一清惊奇地发现，同为八党之一的张永，竟然对刘瑾有着愤怒！
张永原来是刘瑾的党羽，但他不满刘瑾的所作所为。
刘瑾亦发觉张永越来越不归附自己，于是在朱厚照面前挑唆，要把张永赶到南京，而且要连夜起程，不准再入宫。
张永知道后，对朱厚照诉说刘瑾陷害自己。