嘉定方面，情况与江阴有些不相同。
早在五月十三日，扬州失陷、南京弃守的消息传到嘉定，一些不法之徒便聚集到县衙抢掠廪粮，那些奸胥乱卒也跟着乘势劫夺，城中鼎沸。
南明县令钱默错愕不知所为，一面恣其所取，一面派人往吴淞请明嘉定总兵官吴志葵遣兵卒来护送自己出境，并开列了数十个作乱头目的名单，交由吴志葵法办。
五月底，吴志葵的部将来了，护送钱默离开，并按所列名单抓捕了十一人。
这十一人褫衣就缚，赤足行烈日中，途中遇上了清将李延龄及副将总兵官署督抚事土国宝入郡，吴志葵的部将被杀散，十一人复得自由。
清军来了，百姓无主，结彩于路，出城迎之，争着用黄纸书写“大清顺民”四字张贴在自家门口。
六月二十四日，清廷新授县令吴郡人张维熙走马上任。
这天正午，吴志葵安排手下一百余人用白布裹头，埋伏在张维熙必经之路两旁，准备取张维熙性命。张维熙迟迟不来，吴志葵兵饥饿，入民家，乱索酒食。张维熙觉察，仓皇遁逃。吴志葵随后率军进入嘉定。
城内外百姓交口称赞吴志葵所部为恢复之师，悬彩执香，热闹之状胜此前迎清军十倍。吴志葵入城大掠一番，扬长而去。
闰六月初六日，张维熙再次入城上任。初八日，清将李成栋乘坐百余艘大船载步骑二千前往镇守吴淞。黄昏，泊东关外，任由百姓围观。李成栋还派人索美女取乐。张维熙在城里组织了一大群妓女出城慰劳军队。
李成栋喜形于色，坐拥两妓，笑着对围观的人说：“今与尔为一家人，勿畏我也。”
黎明，李成栋留偏裨将梁得胜守东关，自己率主力大军从陆路开往吴淞，沿途剽掠尚不算太重。只有初七日其先头部队经过新泾镇时大肆淫虐，轮奸摧残死了当地七名妇女。
闰六月十二日，剃发令开始在嘉定散布了，人情始惧，变志顿生。
这日，吴志葵遣人通知嘉定百姓，称：“本镇即刻统大兵入县，仰附近百姓于今晚俱用白布裹头，杂插柏枝、竹叶、红箸、鹅毛为号，共剿东关清兵；事成有重赏。”
有吴志葵壮胆，城中乡兵在邑诸生支益、国子生须明征的带领下乘夜袭击驻扎在东关的清梁得胜部，乡兵们四处放火，趁风烧船。
梁得胜猝不及防，混乱中逃出，急奔吴淞。而李成栋自扬州、南京、京口、毗陵等处抢掠所得数不尽的精金、美玉、名剑、宝刀全在大火中散落江中。
清军很多条大船都装满了妇女，悉被焚死。
有一个颜色艳丽的少妇，在大火中挣扎着扑向船头，悲呼道：“我翰林公女，家在扬州，被掠至此，列公哀怜救我！”
乡兵一齐大叫：“速投水中，水浅尚可活。”
美少妇声嘶力竭地叫道：“我是被锁在船。”一语未毕，熊熊大火滚到船头，烈焰冲天，已看不见人影了。
天明，乡兵们才发现，吴志葵军根本没来。
统计战果：斩清兵八十四首级。
吴淞李成栋得知梁得胜被袭、兵船悉尽，气得暴跳如雷，发兵往嘉定扑来。
城中百姓忧怖弥甚，望吴志葵眼穿，再三派人前去联系吴志葵，吴志葵却死活不肯来。
这天夜里出现月食，色暗如漆。
原先，人们就清廷颁布剃发令一事征询著名乡绅侯峒曾的意见。侯峒曾慨然答道：“奋起举义，即不可为，也应与城共存亡！”
侯峒曾乃是天启五年进士，弘光时任通政司左通政使，说话极有分量。
当下，人们决定拥他为主，共同对付李成栋。
侯峒曾义不容辞地担当起大任。
侯峒曾的两个儿子邑诸生侯玄演、侯玄洁，原明都察院观政进士黄淳耀及弟邑诸生黄渊耀均倡义反清复明。
和江阴的阎应元等人一样，侯峒曾等人也制订了一系列战守方案，使得嘉定的守战气象为之一新，声势大振。
李成栋侦得城中早有准备，为求万全，派遣他的弟弟李成林统精骑数十前往娄东请军增援。
李成林一行沿路遭到义兵的截杀，被逼入仓桥街。
义兵们鼓噪大呼，纷纷举火焚烧。
李成林冒死突围，其从骑五人落马。
眼看李成林将过仓桥，嘉定诸生朱元亮找来数十篓烧得炽热的薪炭，全部撒到桥上，复用酒醋泼上，桥石一下子就被烧毁了。
城上发火炮助阵，击杀三人、一马。
李成林跑得正急，突然中炮，手撒佩刀，翻身跌落。
跟在他身后的随从跟着跳下马，抽出腰刀，一刀砍下李成林的首级，挂在鞍边，口中大呼：“我等皆高杰麾下劲兵，自随邢太太降清，所过披靡。嘉定县刁民，杀我副将六员，此仇来日定报！”
蹄声嘚嘚，飞驰东去。
七月初一日，李成栋的大军黑压压直逼嘉定城下。
众乡兵虽不谙兵势，却都争裹粮砺兵前来迎战。
一时间，砖桥东面所聚义兵不下十余万人，排挤拥塞，纷呶如聚蚊，还未开战，已乱成一团。
李成栋的正规军远比义兵有章法，分左、右翼从四面缓缓包抄。
义兵不识阵势，笑称李成栋军为蟹螯阵。
双方开战，清军所出多不过十余骑，且散落不集一处。
义兵遥见清兵出战，更加拥挤，手臂摩戛，轧轧作声。
这种情况之下，胜败已见分晓。
交锋不久，义兵就不战自溃，拥挤在后面往回逃跑的根本不知前面发生了什么事，自相蹈籍，许多人被挤入河中淹死，尸骸乱下，一望无际。
李成栋大陈兵仗，占据了义兵所架高台，挥军入镇疯狂屠戮，共杀一千七十三人，虏去妇女无算。
当晚，李成栋选美妇、室女数十人，安置在姓宣人的大宅中，为了不让这些美妇逃跑，全部除去衣裙，淫蛊毒虐不可名状。
城中不知城外义兵已败，还忙着煮酒饭犒兵，等败讯传回，城中老幼通宵达旦、目不敢交睫，在城中西东南北的荒落之处，各设层台一座，集众驻守。
七月初二日，李成栋自东关往城中发招降榜文，文中有“开门降，誓不杀一人”之句。
有意志不坚定者跑去找侯峒曾等，哭叫道：“大势已去，诸公宜为十万生灵计。”
黄淳耀推案痛哭，孝廉张锡眉等亦悲不自胜。
侯峒曾将李成栋的榜文撕碎，在烈日中督促民夫搬运砖石置城上，一刻也不敢停息。
清兵驻兵于娄塘，解甲韬戈，寂然不动。
黄昏时分，风景惨淡，鬼声啾啾，城内民众掩泪相视，共知必死无疑。
初三日，李成栋所请的娄东清兵已至，尽锐攻城，炮声轰轰不绝。
守城百姓，股栗色变。
侯峒曾等人分头慰勉大家，说：“我与尔曹室家妇子尽在，少有蹉跌，万家同命矣。”
入夜，城下清兵越聚越多，攻势越来越急，举炮越来越繁，终夜震撼，地裂天崩，炮硝铅屑落城中屋上簌簌如雨。
初四日五更，大雨倾盆，守城百姓昼夜站在雨中，双眼浥烂，头晕欲倒，已经难以坚守了。
清兵发现守城者出现松懈，欢声雷动，多缚软梯至城下。
一员清将以大桌覆其面，蹑梯而上，势如飞鸟。
城上义兵见了，齐声惊呼，砖头、石块全向其招呼过去。
但已经来不及了，那清将已到城头，丢弃大桌，一跃而登，用利斧断开城门，纵兵大入。
侯峒曾正坐在城楼上指挥，两个儿子侯玄演、侯玄洁看见形势大急，问道：“事急矣！何以为计？”
侯峒曾答道：“有死而已，复何言！所恨者，枉送一城百姓耳。”一语未竟，身后有人大呼“城已破”。
侯峒曾让两个儿子逃命，两个儿子不从。侯峒曾怒斥道：“我死国事，分也；祖母在，若辈应代我奉事，恋我何为！”
两个儿子恸哭而去。至孩儿桥，均被杀。
侯峒曾打算在宣家池自溺，水太浅，侯峒曾弯下腰溺了几次，均没死成。他长立水中，叹道：“人死亦大难事！”回头吩咐亲兵宪时隶将自己的脑袋按下水中，宪时隶泣不能从。
侯峒曾大怒，再三斥责，宪时隶这才含泪忍悲按他的头颅入水，然而，啾啾有声，始终溺不死。
折腾了好久，被追杀来的清兵发现了，用刀将他杀死，献首于李成栋。
黄淳耀取笔留书：“遗臣黄淳耀于弘光元年七月初四日自裁于西城僧舍。呜呼！进不能宣力皇朝，退不能洁身自隐。读书寡益，学道无成；耿耿不灭，此心而已。异日寇气复靖，中华士庶再见天日；论其世者，尚知予心！”与弟弟黄渊耀双双悬梁而尽。
孝廉张锡眉守南城，其早在六月二十六日就写好了绝命词，云：“与城存亡，死亦为义；后之君子，不我遐弃！”等到城破，先驱妾入水，然后从容自溺。
教谕龚用圆抱着他的兄长邑诸生龚用广大恸：“我祖父清白自矢，已历三世；今日苟且图存，何面目见祖宗于地下！”两兄弟一起投水，等尸体浮出水面，两手仍旧紧紧握在一起。
李成栋入城，下令屠城，兵丁遂挨家挨户，细细屠戮。小街僻巷，无不穷搜；乱苇丛棘，必用枪乱搅，知无人然后已。一时间，刀声割然遍于远近，乞命之声嘈杂如市。所杀不可计数，其悬梁者、投井者、断肢者、血面者、被砍未死手足犹动者骨肉狼藉，弥望皆是。投河死者，亦不下数千人。
三日后，自西关至葛隆镇，浮胔满河，舟行无下篙处；白膏浮于水面，岔起数分。
妇女寝陋者，一见辄杀。大家闺彦及民间妇女有美色者，皆生虏；白昼于街坊当众奸淫，恬不知愧。有不从者，用长钉钉其两手于板，仍逼淫之。
嘉定风俗雅重妇节，惨死者无数。
初六日，李成栋拘集民船，装载金帛、子女及牛马羊豕等物三百余艘，心满意足地开往娄东；普通一点的财物木棉，悉委弃不取。
初十日后，士民幸脱者始络绎入城；见室家零落、里井萧然，无不放声大哭。
但，这还不是灾难的结束。
二十三日，江东义士朱瑛自称游击将军，率五十人入县，聚集起逃跑在周遭的两千多民众处死归降清军者和清军委派的官吏，并在葛隆袭击李成栋的一支小分队。
李成栋勃然大怒，连夜回军攻破嘉定，再一次展开丧心病狂的大屠杀。
屠杀到天明，李成栋命兵将将死尸堆积在一起，放大火焚烧掉，这才兴尽离去。
让李成栋想不到的是，过了二十多天，原南明一个名叫吴之番的将军攻入嘉定，得到了周边民众的响应。
李成栋气得肺都要炸了，再次整军反扑。
双方在城下展开血战，吴之番战死。
李成栋第三次屠城，不但把吴之番手下士兵赶尽杀绝，也将近二万刚到嘉定避乱的民众杀得干干净净。
这就是历史上臭名昭著的“嘉定三屠”。
读史每读到这一段，痛泣之余也不由得痛恨——都说满清入关杀人残暴，其实，汉人杀汉人更加残暴，李成栋一军虽然打着清军的旗号，但其全军编制基本上都保持当年高杰时代的规格不变，兵还是那些兵、将还是那些将，都是清一色的汉人子弟——明亡清兴的过程的确是中华民族的一个巨大劫难，但，我们也不应该把这笔账全部记在女真人的头上，这其中，许许多多民族败类、暴徒、杂碎、人渣的作恶程度并不输于凶残的入侵者。
补一下在江阴守城、嘉定守城过程中露过一会儿脸的镇南伯黄蜚、吴淞总兵吴志葵等人的结局。
这黄蜚便是当年引发黄得功与高杰互相厮杀的关键人物，值此南明危亡之际，他没有辜负一个军人应有的职责，以大义为重，起用弘光朝吏部考功司主事夏允彝为监军，与吴志葵一起引军突击苏州。八月初六日，被清军围困于泖湖，黄、吴两军水师船只高大，运转不灵，清军船小，乘风纵火，明军船只大部分焚毁，黄蜚、吴志葵都被生擒，于九月初四日在南京遇害。
监军夏允彝眼见兵败无成，于九月十七日在淞塘投水自尽。
夏允彝，字彝仲，别号瑗公，松江华亭（今上海松江）人，明嘉定总兵官吴志葵的老师，好古博学，擅长词文。
明嘉定总兵官吴志葵拥兵抗清，夏允彝入其军充当监军。
吴志葵军败，夏允彝虽幸免于难，但已心死如灰，决意自杀殉国，九月，毅然赴淞塘自尽。
夏允彝殉国之日，阖家老少皆在池边哀恸观视。
松塘水太浅，仅至腰际，夏允彝死志已决，竟然在没有任何人帮助的情况下，硬生生地将自己脑袋埋于水中，呛肺而死。
咽气时，背部的衣衫并未沾湿！