陈独秀说苏曼殊：“至于人情世故上面，曼殊实在也是十分透彻，不过他不肯随时俯仰，只装作癫癫疯疯的样儿，以佯狂免祸罢了。章太炎做的文章上，说他不解人事，几乎形容他是个傻子，其实他住在日本的时候，太炎和刘申叔冲突的原因，他完全是明白的。好在他们都当他是傻子，什么事不去回避他，而他也一声不响，只偷偷跑来告诉我。”晚年，陈在狱中说：“苏曼殊是个风流和尚，人极聪颖，诗、文、书、画都造上乘，是大有情人，是大无情人，有情说他也谈恋爱，无情说他当和尚。”
孙中山将苏曼殊与当时的名僧太虚和尚进行比较道：“太虚近伪，曼殊率真。内典工夫，固然曼殊为优；即出世与入世之法，太虚亦逊曼殊多多也。”
周作人对苏曼殊作了多方位的评价：
评价曼殊其人云：“曼殊是一个很有天分的人，看他的绝句与小品文可以知道，又生就一副浪漫的性情，颇足以代表革命前后的文艺界的风气。”
批评他的思想云：“但是他的思想，我要说一句不敬的话，实在不大高明，总之逃不出旧道德的樊篱——这在诗人或者是难免的？……曼殊思想平常，或者有点像旧日读书人……”
评价他的诗文云：“他的诗文平心说来的确还写的不错，或者可以说比一般名士遗老还要好些，还有些真气和风致，表现出他的个人来，这是他的长处。”
评价他在文学史上的地位云：“先生说曼殊是鸳鸯蝴蝶派的人，虽然稍为苛刻一点，其实倒也是真的。”“曼殊在这派里可以当得起大师的名号，却如儒教里的孔仲尼，给他的徒弟们带累了，容易被埋没了他的本色。”
茅盾评论苏曼殊的作品说：“我好像看见作者的太赤热的心，在冷冰冰的空气里跳跃。它有很多要诅咒，有很多要共鸣，有很多要反抗。它焦灼地团团转，终于找不到心安的理想、些微的光明来。”
苏曼殊友人姚鹓雏评价道：“君心胸意趣如魏晋间名流，吐属妍雅，而蕴藉不露圭角。游人间世，翛然如闲云野鹤，不可以常意拘，类如此矣。张融所谓：‘不恨我不见古人，所恨古人不及见我耳。’又曰：‘不可无一，不可有二。’君其几之。……曼殊遗落一切，逸韵自喜，故著述不多，亦非经营刻意以为之者。天资绝特，于学无所不通，而深自敛抑，勿以炫世。善言《易》者不言《易》，朋辈中一人而已。”
梦舟将苏曼殊与李白相比较道：“太白肆傲人间，以获得后而贱视高官厚禄为得意；曼殊不傲也不谄，悠然物外，除了吸吕宋烟、吃冰、写作和病以外无他事，老早把高官厚禄看不上眼。翻开曼殊的遗札一看，任你如何找法，也找不出《李白与韩荆州书》那样的东西。在诗方面说，李白诗天马行空，雄放绮丽。而曼殊的诗，却没有一首不是充满了秀逸悲愁的意境的。……曼殊死在壮年里，人们多说他据有天才的华宫外，也有着非常之努力，故能够懂得几国的文字，同时又能够欣赏了那么多的古文艺作品。如果用普通人的学力去衡度，就在时间上算，曼殊也决不能学得那么多东西。其实曼殊有的，只是天才，天才之外，就是兴味。”
郁达夫说：“苏曼殊是一位才子，是一个奇人，然而绝不是大才。天才是有的，灵性是有的，浪漫的气质是很丰富的，可是缺少独创性，缺少雄伟气，……曼殊的才气，在他的译诗里、诗里、小说里、画里，以及一切杂文散记里，都在流露闪耀，可是你要求一篇浑然大成的东西，却在他集子里寻找不出。……笼统讲起来，他的译诗，比他自作的诗好，他的诗比他的画好，他的画比他的小说好，而他的浪漫气质，由这一种浪漫气质而来的行动风度，比他的一切都要好。”
郁达夫又说：“苏曼殊的名氏，在中国文学史上，早已是不朽的了。”
有人评价道：“作家许地山（落华生）是入世的‘真人’，而和尚苏曼殊是出世的‘情人’。”
文公直叹道，曼殊“如孤芳自赏之菊花，如出泥不污之莲花，如傲雪冲寒之梅花，如幽香淡雅之兰花。……曼殊之性情，过于狷洁，过于明白，故不为浑浊之时代所容”。
刘太希总结道：“曼殊上人一生，行畸，遇畸，文畸，诗畸，画畸，殆无不畸，庄子曰：畸人者，畸于人而侔于天，观于上人良信。上人之画，不必师南北二宗诸大师，而自合榘度，其所作，疑皆寓身世难言之恫，以不着点尘之笔，写不可一世之情，扣于窈冥，诉于真宰，一丘一壑，妙极其微，或钓艇荒滩，灵旗破庙，或金轮飞锡，千刃振衣，或敷行衰柳，摇落山川，或红叶小桥，有人吹笛，莫不神出古异，灵光接天，表圣有言，性情所至，妙不自寻，遇之自天，冷然希音，上人画境，当于此中喻之，殊不能以一家一派，量度其价值也。”
友人高燮曾诗赠苏曼殊曰：“住心常觉众生苦，冷眼犹嫌热泪多。”
顾彬说：“苏曼殊是文言文最后一位大师，同时也是第一位对于病态没有采取回避态度的作家，在作品中对病态做了不加粉饰的描写。”
在陈平原看来，苏曼殊出于脱苦脱俗的需要，强迫自己信仰佛教，潜意识里却始终浮躁不安，他的作品正是“在东西文化、俗圣生活的矛盾中苦苦挣扎的心灵的自白”。
茗山大师说，自己在“禅堂参悟，而曼殊于妓院得道”。
印顺大师说：“中国有两大诗僧，前有佛印，今有曼殊。”
戴季陶回忆道：“我还记得死朋友中，有一个苏玄瑛，这个人是我所不愿学，同时也是我所不能学的一个人。他的性情，也很有超绝一切的去处，但是他到底是一个个人主义的结晶。就超生活的一面看，他也是一个人类中的优秀，却是在生活里面看，他倒是一个累世的人。这样的人，高而不崇，洁而不纯，于个人可成为良友，与社会绝不能不说是赘疣。”